Fakultas Farmasi Universitas Nahdlatul Ulama Kalimantan Timur selalu berupaya meningkatkan mutu pendidikan dan pembelajaran, salah satunya ada menjalin kerjasama dengan instansi kesehatan, organisasi profesi kefarmasian dan lembaga-lembaga yang berhubungan dengan pembelajaran kefarmasian.
- Kerjasama dengan Pengurus Cabang Ikatan Apoteker Indonesia (PC IAI) Samarinda
- Kerjasama dengan Pengurus Cabang Persatuan Asisten Farmasi Indonesia (PC PAFI) Samarinda
- Kerjasama dengan Pusat Pelatihan Pertanian dan Pedesaan Swadaya (P4) Puri Leisa Samarinda
- Kerjasama dengan Otorita IKN
- Kerjasama dengan Forum CSR Samarinda
